DNA纯化方法和流程概述?

DNA纯化方法和流程概述?

BiteSizeBio列出了“清理 DNA 样本的 5 种方法”。在某种程度上,这个总结是过时的并且具有误导性。让我们来看看它们是如何工作的。

  1. 苯酚-氯仿萃取以去除蛋白质。将 DNA 溶液与苯酚和氯仿混合。水溶性 DNA 分配到水相中,而蛋白质在有机溶剂存在下变性,从而留在有机相中。

  2. 乙醇沉淀脱盐。在 DNA 提取中,盐通过破坏将核酸固定在一起的蛋白质链来释放 DNA 链。由于 DNA 不溶于乙醇。在乙醇溶液中,盐使 DNA 不易溶于水,同时有助于保持蛋白质(有机小分子)溶解在水中。结果是,DNA 分子聚集并从溶液中沉淀出来。

  3. 基于硅胶柱,使用硅胶或硅胶珠和离液盐。离液盐会破坏链之间的氢键,促进 DNA 与二氧化硅的结合以及与样品其余部分的分离。

  4. 阴离子交换使用带正电荷的 DEAE 功能化树脂结合带负电荷的 DNA 磷酸主链。

  5. 磁珠使用磁珠以 pH 依赖性方式有条件地结合 DNA,让您只需控制 pH 即可将 DNA 与样品的其余部分分离。磁珠带正电,在低 pH 条件下结合 DNA,但在高 pH 条件下,它们带负电荷,从而释放 DNA。

前两个实际上是称为有机提取的DNA 提取方法的一部分,该方法包括裂解步骤、苯酚氯仿提取、乙醇沉淀和洗涤步骤。

后 3 个用于 DNA 清理。所有步骤都包括结合、洗涤和洗脱步骤。其中基于磁珠的方法,因为不需要离心和其他耗时的处理步骤。它是高通量处理自动化的理想选择。由于它是现在的主流方法,珠子的成本在过去十年中下降了一半。

如何净化DNA?

DNA纯化方法和流程概述?

图 3. DNA 纯化工作流程。

  1. 混合:将纳米颗粒与 DNA 样品混合。

  2. 结合:当与样品混合时,纳米粒子与目标 DNA 样品结合。

  3. 清洗:使用磁力(例如磁力分离架)来拉动和聚集结合的材料。通过抽吸去除未结合的材料,剩下的是纳米颗粒结合的目标。

  4. 洗脱:从纳米颗粒中释放结合的目标样品。清洁后的 DNA 样品即可用于下游应用。

免疫组织化学工作流程

免疫组织化学工作流程

VECTASTAIN ®  ABC 系统使我们成为免疫组织化学 (IHC) 和免疫细胞化学 (ICC) 领域的先驱,并且我们在这些领域仍然是值得信赖的品牌。我们的产品因其高灵敏度、低背景、可靠性、再现性和价值定价而受到好评。我们提供许多不同的检测系统来适应广泛的实验优先事项。

为您的 IHC 检测选择合适的试剂是优化实验方案的重要组成部分。 Vector Laboratories 是您 IHC 工作流程每个步骤中优质标记和检测产品的资源。

载玻片准备

· 大化组织切片在载玻片上的保留和粘附。

· 划分和隔离各个部分以减少试剂使用或进行离散处理。

抗原修复

使用规定的 pH 值和盐溶液提高醛固定制剂的组织抗原性(“免疫反应性”)。醛固定(例如福尔马林)和石蜡包埋过程中的热暴露相结合会使表位难以检测。在抗原修复过程中,组织会受到缓冲溶液和高温的组合处理,这会导致蛋白质发生构象变化,从而暴露抗原以供检测。

淬火/阻断

使用封闭溶液减少或消除组织切片和细胞制剂上不需要的背景(非特异性)染色。非特异性染色可能是由内源酶或组织成分引起的,包括内源酶活性、Fc 受体的存在或检测试剂与组织或细胞蛋白和其他大分子的相互作用。根据阴性对照切片的结果选择封闭溶液。

一抗/凝集素

使用经过验证的特定标记物来识别和定位细胞或组织制剂中的靶蛋白抗原或糖蛋白部分。选择一抗或凝集素时,请考虑组织种类和组织制备方法(例如固定),以确保与靶标特异性结合。

二抗

选择高度纯化和最佳偶联的检测试剂以满足检测条件,例如一抗种类、组织种类、靶标丰度和易用性(浓缩或即用型)。

三级试剂

如果需要,提高检测的灵敏度,以可视化弱或短暂表达、上调或未知(例如,基因敲入研究)抗原。

底物/显色剂

使用酶特异性显色显色来可视化您的目标蛋白抗原及其细胞和/或细胞外定位和相对表达水平。选择符合您颜色偏好且与其他系统试剂兼容的酶底物(例如复染剂、封固剂和其他底物(如果多重检测))。

复染

使用对比核染色来澄清异质形态结构内的靶抗原信号。这有助于阐明组织中的细胞结构和特定染色模式。选择与酶底物形成对比且与底物和封固剂化学相容的复染剂(蓝色、绿色或红色)。

盖玻片/封片

保留目标抗原染色剂以供短期或无限期存储和存档。选择与您的底物和复染剂兼容的封固剂。使用非水封固剂封固要存档的载玻片,或使用水性封固剂保存长达数年。

代谢组学的分析流程

代谢组学的分析流程

一般来说,代谢组分析流程如下:首先对代谢物进行预处理,预处理的方法由测量分析方法决定。如果采用质谱分析,则需要提前将代谢物分离并电离。然后对预处理后的组分进行定性和定量分析。

在预处理中,常用的分离方法包括:气相色谱法(GC)、高效液相色谱法(HPLC)。气相色谱分辨率较高,但需要代谢组分气化,对组分的分子量有一定限制。高效液相色谱也广泛应用于代谢组分析,因为它在液相中分离代谢成分,因此不需要气化成分。与气相色谱法相比,其测量范围更宽,灵敏度更高。优势。此外,毛细管电泳还可以分离代谢成分,应用较少,但理论上其分离效率高于高效液相色谱。

在预处理过程中,常常会添加内标,以方便后续对样品质量的监测和比较。由于不同的实验批次和进样顺序对后续测量也有一定的影响,因此还添加了空白对照。与混合样品进行比较以进行质量监控。

对不同代谢成分进行定性和定量分析的方法包括质谱法(Massspectrometry,MS)和核磁共振波谱法(NuclearMagneticResonanceImaging,NMR)。其中,质谱法具有灵敏度高、特异性强的优点,广泛应用于代谢物的检测。它可以对分离和电离后的代谢物进行定性和定量。电离方法包括:常压化学电离(Atmospheric-Pressure Chemical Ionization,APCI)、电子电离(Electron ionization,EI)、电喷雾电离(Electrospray ionization,ESI)等,需要根据不同的分离方法进行选择。例如,电喷雾电离通常用于通过液相色谱分离组分。然而,由于质谱法不能直接检测生物溶液或组织,其应用受到了限制。为了提高原有质谱分析的灵敏度、简化样品制备、减少背景的影响,一些新的质谱相关技术得到了发展。这些技术包括:二次离子质谱 (SIMS) 和纳米结构引发剂 MS (NIMS),它们都是解吸/电离方法,两者均与基质无关。其中,SIMS利用高能离子束解吸样品的接触表面,具有空间分辨率高的优势,是与质谱联用的器官/组织成像的强大技术。 NIMS可用于小分子的检测。基质辅助激光解吸/电离(MALDI)是一种较为温和的电离方法,可以获得一些常规电离方法容易解离成片段的完整大分子的质谱信息,如DNA、蛋白质、肽和糖等。解吸电喷雾电离 (DESI) 是一种直接电离技术,可与质谱法串联使用,在大气条件下直接分析样品。其原理是利用快速移动的带电溶液流从接触表面提取样品,可用于法医分析、药物、植物、生物组织、聚合物等的分析。激光烧蚀电喷雾电离(LAESI)是一种结合中红外激光烧蚀和二次电喷雾电离的直接电离技术,可用于多种样品,包括植物、组织、细胞,甚至血液、尿液等未经处理的生物溶液,已应用于食品监管、药品监管等领域。核磁共振波谱不需要预先分离代谢组分。与质谱分析相比,核磁共振波谱具有结果重现性更好、样品制备更简单、无需预分离、对样品破坏较小等优点。它低于质谱法(有争议,一些人认为这是由于样品预处理工作流程不正确),但由于其易用性也被广泛使用。药品监管等领域。核磁共振波谱不需要预先分离代谢组分。与质谱分析相比,核磁共振波谱具有结果重现性更好、样品制备更简单、无需预分离、对样品破坏较小等优点。它低于质谱法(有争议,一些人认为这是由于样品预处理工作流程不正确),但由于其易用性也被广泛使用。药品监管等领域。核磁共振波谱不需要预先分离代谢组分。与质谱分析相比,核磁共振波谱具有结果重现性更好、样品制备更简单、无需预分离、对样品破坏较小等优点。它低于质谱法(有争议,一些人认为这是由于样品预处理工作流程不正确),但由于其易用性也被广泛使用。有些人认为这是由于样本预处理工作流程不正确造成的),但由于其易用性,它也被广泛使用。有些人认为这是由于样本预处理工作流程不正确造成的),但由于其易用性,它也被广泛使用。

此外,其他检测方法还包括:离子迁移谱分析(Ion-mobilityspectrometry,IMS)是一种基于电离分子在气相载体中的迁移来分离和分析这些分子的技术。灵敏度高,可单独使用或与质谱、气相色谱或液相色谱串联使用。电化学检测技术与高效液相色谱 (HPLC-ECD) 相结合,可用于测量复杂基质中的低含量成分,具有易用性、灵敏度和选择性。应用于临床研究、食品检测、药物检测等领域。拉曼光谱基于振动光谱,可以检测化合物的结构及其微小变化。具有不破坏样品、样品前处理简单、和高空间分辨率。它已用于临床病理学研究和微生物分类。以及检测、化合物分析等领域。