鹿genius®分子疫学分析POT配套元件(绿脓菌用)|分子疫学分析POT套件|生化学试剂-基因工程|试剂|关东化学株式会社

鹿genius®分子疫学分析POT配套元件(绿脓菌用)|分子疫学分析POT套件|生化学试剂-基因工程|试剂|关东化学株式会社多药耐药性绿脓菌(Multiple – Drug – ResistantPseudomonas aeruginosa:MDRP),是主要的抗生素对获得了广泛耐药性绿脓菌,分离报告和院内感染的事例,各地的医疗设施多被报告。 爱知县卫生研究所的铃木匡弘老师和金泽医科大学的老师们由嗣饭沼开发的PCR -根据ORF Typing(POT)法,多路PCR用绿脓杆菌中的多数特定基因领域进行放大、琼脂糖凝胶电泳增幅被的乐队图形分析方法。 这个方法的基础上,本试剂盒,绿脓菌基因领域的符号简便数值化的可能。 脉冲电场凝胶电泳(PFGE)和Multilocus Sequence Typing(MLST)法和同等的识别能力具有。 *参考:厚生劳动省科学研究费补助金新型流感等新兴·复兴感染症研究事业,新型耐药性菌関研究平成23年度总结·分担研究报告,研究代表荒川宜親

特长

约4小时的分子疫学分析可能

脉冲电场凝胶电泳(PFGE)不同的通用设备测定可能

解析结果数值化(POT值)的事,菌体间的相比较可能同性

配套元件的构成

个别名称 容量 数量
试剂A AptaTaq DNA主人(5×Conc .)* 500μL 一本书
试剂B PCR附录 500μL 一本书
试剂C 引物混合α 250μL 一本书
试剂D 混合β引物 250μL 一本书
试剂E 积极控制 250μL 一本书
试剂F 6×装入缓冲区(BPB·XC) 500μL 一本书
* AptaTaq DNA主人(5×Conc设置Roche Diagnostics K . K .的商品。

操作步骤

绿脓菌块儿的(培养)
DNA抽出,进行模板DNA制备
两种多路PCR
琼脂糖凝胶电泳
乐队的读取模式
POT值的计算
各样品的POT值的比较分析

解析

鹿genius®分子疫学分析POT配套元件(绿脓菌用)|分子疫学分析POT套件|生化学试剂-基因工程|试剂|关东化学株式会社

电泳模式

50 : 50个基点DNA梯形P:积极的控制1:ATCC®27853
2:ATCC®355543:PAO 14:IMP阳性临床分离股票5:VIM阳性临床分离股票6:临床分离股票7,8:集体感染事例1中所得到的临床分离股票9,10:集体感染的事例2从中得到的临床分离股票 泳动条件,是4%琼脂糖KANTO A的酒馆熊猫聚会(0.5×TBE缓冲液),电泳装置用,120 V 50分钟。25孔的梳子,用样品3μL电器了泳动了。

检测ORF的种类(目标区域)及其PCR扩增产物尺寸

POT No . 放大尺寸(bp) 目标领域
Reactionmixture 1 PCR PC 506 positive control <em>aeruginosa P .</em>
POT 1 – 1 336 Genomic Islet – 1
POT 1 – 2 281 Genomic Islet – 2
POT 1 – 3 235 Genomic Islet – 3
POT 1 – 4 201 Genomic Islet – 4
POT 1 – 5 175 Genomic Islet – 5
POT 2 – 1 151 VIM
POT 2 – 2 126 职业噬菌体- 1
POT 2 – 3 103 职业噬菌体- 2
POT 2 – 4 85 职业噬菌体- 3
Reactionmixture 2 PCR PC 506 positive control <em>aeruginosa P .</em>
POT 1 – 6 324 Genomic Islet – 6
POT 1 – 7 271 Genomic Islet – 7
POT 1 – 8 238 Genomic Islet – 8
POT 1 – 9 204 Genomic Islet – 9
POT 1 – 10 176 Genomic Islet – 10
POT 2 – 5 150 职业噬菌体- 4
POT 2 – 6 124 职业噬菌体- 5
POT 2 – 7 105 IMP

PCR PC,绿脓杆菌检测用的PCR积极控制指。

①2个多路PCR的电泳结果从乐队读取模式。 ②这电泳乐队的有无的结果用,POT值分析用EXCEL表二进法输入,2个类别的POT值计算出。 无论PCR电脑阳性的情况,那个样品是绿脓菌,可以确认。另外,MDRP的场合,POT 2的值的合计为64以上或奇数。 不论样品之间的POT值进行比较,菌体间的相同性客观的推测。 在集体感染得菌身体,POT 1~2 POT值全部同一。

范畴 样品号码
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
POT 1 636 572 可以 646 207 887 410 410 646 646
POT 2 48 58 0 9 122 6 8 8 8 8

产品信息

产品名 包装 产品编号
鹿genius®分子疫学分析POT配套元件(绿脓菌用) 一包(50次) 08187 – 96
鹿genius®DNA抽出试剂 一包(120次) 08178 – 96

最新的价格是Cica – Web请参照。

本试剂盒是从爱知县专利许可,制造销售。其他厂家的商品相关的许可证、专利方面,各厂商请确认。

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POT套件·PCR套件

产品名 包装 产品编号
鹿genius®分子疫学分析POT套件(黄色葡萄球菌用) 一包(30回) 08180 – 96
一包(120次) 08180 – 97
鹿genius®分子疫学分析POT配套元件(不动杆菌属菌用) 一包(30回) 08062 – 96
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鹿genius®カルバペネマーゼ基因型检测试剂盒 一包(30回) 08114 – 96
鹿genius®致病基因检测试剂盒(PCR腹泻原性大肠菌用) 一包(100次) 08087 – 96
鹿genius®毒素基因检测试剂盒(C . difficile用) 一包(30回) 08115 – 96
鹿genius®コアグラーゼ检测套(黄色葡萄球菌用) 一包(50次) 08179 – 96

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分离培养基

产品名 包装 产品编号
黑藻アガーMDRP屏幕培养基 10张 72108

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电泳相关

产品名 包装 产品编号
琼脂糖KANTO A的酒馆熊猫聚会了 100克 01089 – 23
10×TBE缓冲液 一L 46510 : 79
溴化乙锭溶液(2毫克/毫升瓶装),眼药水 10毫升 14575 : 43
Quick‐Load Purple 50个基点DNA Ladder gel lanes
250
49914 : 40
6倍浓缩装入缓冲器 2 mL×6本 24080 – 96

最新的价格是Cica – Web请参照。

宣传手册、说明书(PDF)

小册子鹿genius®分子疫学解析配套元件(绿脓菌用)(399 KB)

小册子鹿genius®POT套件系列(1.3 MB)

小册子鹿genius®基因检测试剂盒推荐组套(978 KB)设备

小册子基因检测相关产品指南(2.3 MB)

取扱说明书(971 KB)

计算表(ZIP文件,Excel)

POT值分析用EXCEL表(ZIP文件,522 KB)

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传真: 03 – 3241 – 1047

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NGS接龙丨恒特基因首席科学家郑宗立:专注肿瘤测序,加速技术创新

NGS接龙丨恒特基因首席科学家郑宗立:专注肿瘤测序,加速技术创新

由测序中国发起的NGS接龙第二季活动正在进行中,本期NGS接龙的嘉宾为恒特基因首席科学家郑宗立博士,让我们听听他与基因测序之间的故事。

兴趣指引方向,铺就NGS之路

第一次接触NGS是在2008年,正值我于瑞典卡罗林斯卡学院(Karolinska Institute)攻读医学流行病学博士。在当时,瑞典国家传染病研究所引入了瑞典第一台罗氏454测序系统,并利用其进行了大量的微生物测序工作。近水楼台先得月,凭借当时的便利条件,我也得以接触到了早期的NGS技术和二代测序平台。

俗话说,兴趣是最好的老师,古往今来人们开始探索,都起源于对自然万物的惊异,以好奇的目光往往可以看到更深远的事物。测序技术的发展为生命科学带来了新的可能,与同时代的其他“全基因组”方法相比,NGS技术具有强大的性能,其对生物本质的DNA信息的呈现能力大大超过同时代的其它众多生物技术,极具潜力,具有广阔的应用前景,对推动生命科学领域的发展有着重要的意义。虽然当时我并非专门进行测序的研究,但是在跟测序打交道的过程中,逐渐对其产生了浓厚的兴趣,并渐渐为之着迷。

早期的NGS技术在稳定性上存在很多缺陷,同时实验室内的操作流程也极为复杂、繁琐,很容易出现各类技术问题。凭借着我在生物信息学以及统计学的背景,并结合早期二代测序的原理,在当时对其进行了深入的研究,提出了运用泊松分布来预测反应单元中分子的重复率,并针对罗氏454测序系统开发了众多实验室新方法,省去了实验过程中不必要的环节,使其操作更加简单的同时使其产出更多高质量的测序数据。相关的研究在当时发表于Nature Protocols上,直至今日仍有很多公司在使用。

肿瘤病理、靶向治疗以及NGS的融合发展

博士毕业之后,我思考着未来的方向。在当时,我的脑海中有三个关键词:肿瘤病理、靶向治疗以及NGS,这三者若能结合在一起,必将成为未来的发展方向。恰逢新英格兰医学杂志发表了麻省总医院的一篇文章,麻省总医院当时在肿瘤靶向治疗领域处于世界前沿,这篇文章为FDA批准针对肺癌的第二个靶点ALK基因融合的靶向治疗奠定了基础。当时也恰逢Ion Torrent测序平台刚刚推出,麻省总医院也引进了这一测序平台。于是我与它们取得了联系,并一拍即合,一个月之后我便来到了其实验室进行这方面的研究。

我的研究一直瞄准于NGS的临床应用,而肿瘤分子诊断中最大的困难就是FFPE样本自身的局限性,样品中的DNA和RNA常常有模板断裂、模板损坏等问题,不但限制了一些检测方法的应用,而且测序结果中往往含有很多错误。基于这样的局限性,我们对技术进行了创新研发,针对医院的临床需求发明了基于二代测序的肿瘤分子检测AMP(Anchored multiplex PCR,锚定多重PCR)技术,现已被广泛应用于美国临床和科研,结果发表在Nature Medicine杂志上,目前已经成为麻省总医院主要的分子病理检测方法。AMP是一种为NGS生成富集目标序列文库的快速、简单、易扩展的方法。该技术可用于FFPE中的RNA、基因组DNA进行富集测序,可在数小时内轻松建成测序文库,且适用于各种类型及质量参差不齐的临床样本,特别是微量核酸样本,其构建的目标基因二代测序文库优于传统的多重PCR制备文库。AMP是在2012年完成实验设计,2013年进行大规模的临床验证。其间,Foundation Medicine于2013年在Nature Biotechnology上发表了他们的方法,我当时感到压力很大。据我所知,对于基因融合的检测,虽然有很多方法对某些样品、某些融合变异也能检测出来,但是至今没有其它方法像AMP这样,有系统性地大规模的临床FFPE样本验证,并达到100%的灵敏度和100%的特异度。正因为这样的结果,我的导师John Iafrate(以前为FDA编写FISH法检测基因融合的标准实验流程)在自己的实验室已经全面将FISH法替换成了AMP法了(FISH法至今仍是众多实验室的金标准)。

在麻省总医院的研究中,除了对实验环节进行技术优化,针对测序数据,我也从实验设计者的角度对其数据分析进行了优化,使生物信息学的软件更加灵敏。在我离开实验室时,应用AMP参与的一项发表在New England Journal of Medicine研究结果为FDA批准针对肺癌的第三个靶点ROS1基因融合的靶向治疗奠定了基础。

抓住“小鲨鱼”,放过“小金鱼”

早发现、早干预、早治疗是癌症防治的黄金守则,肿瘤的早期筛查是降低肿瘤的死亡率的重要措施。液态活检技术不仅在对肿瘤患者进行用药指导、疗效跟踪、复发监测方面相比传统的肿瘤检测方法如侵入性的组织活检方法具有明显的优势,并且在肿瘤早筛方向有着很好的应用前景。然而,早期癌组织释放到血液中的突变游离DNA(cfDNA)占血液中总游离DNA的比例常常很低,千分之一甚至更低,且驱动肿瘤生长的基因众多。因此,肿瘤cfDNA检测必须同时满足多基因和高灵敏度两个技术要求,这是液态活检技术在肿瘤早筛领域需要突破的一道技术障碍。

液态活检发展至今,已经取得了一些令人兴奋的结果,同时也面临着巨大的挑战。目前包括Grail在内的多家公司对此方面花费大量研发精力,期望早日解决液态活检在肿瘤早期检测应用中的关键问题,并最终减低癌症死亡率。

回国后,我联合几位创始人创办了恒特基因。恒特基因目前专注于肿瘤精准检测的关键技术,应用于癌症的精准治疗和早期筛查,积极开展肿瘤防治的工作。

大鱼是从小鱼长大的。大型的肿瘤测序研究如TCGA和ICGC对“大鱼”作了详尽的分析,为我们及时找到未成气候的、游离的“小鱼”提供线索 。将肿瘤细分并打个比方,按良恶性分成恶性肿瘤(鲨鱼)和良性肿瘤(金鱼),按时间进展分成小鱼(如存在于血液中的肿瘤的蛛丝马迹)和大鱼(临床肿瘤)。你也许会说青蛙是从蝌蚪成长起来的,长大了就变了,但是,即使蝌蚪的形态变化了,其注定成长青蛙的基因没有发生变化。早期筛查的一个关键是找到小鲨鱼,放过小金鱼。如果是肿瘤注定是恶性的,就应该积极采取行动,不要等到变成大鲨鱼了就晚了,然而这种遗憾时不时都在发生。反过来,如果是小金鱼,应该避免过度诊断,避免比如因人群乳房造影筛查和前列腺特异抗原筛查的阳性结果,而进行的不必要的组织抽样,所造成的身体伤害和焦虑(所谓“不作死就不会死no zuo no die”)。如何正确区分小鲨鱼和小金鱼,如何区分小鲨鱼的地域品种(肿瘤组织来源),还要依赖前瞻性的人群大规模研究来进一步论证或揭示:哪些基因的变异与肿瘤的发生有关;哪些基因的变异是不同原位组织的特征;哪些基因的变异与肿瘤的良恶程度有关—我们都拭目以待。

共建大型前瞻性人群队列,推动肿瘤早筛发展

中山市肿瘤研究所是我国肿瘤早诊早治基地之一,建立了完善的肿瘤病例登记系统及大型的高危人群连续跟踪样本库,为开展前瞻性大规模队列研究奠定了基础。大家也许知道,根据全国肿瘤登记中心的估算,2015年我国新发癌症病例和癌症死亡人数分别有429万和281万【陈万青教授等发表在CA CANCER J CLIN杂志(影响因子137分)】。其中,中山市是全国为数不多的几个中心,能提供高质量数据用来做全面的分析,包括1)时间趋势分析;2)生存分析;3)被国际癌症研究组织IARC收录于2014年的五大洲统计年鉴。

恒特基因开发了新一代技术平台PANO-SeqTM,并与中山市人民医院/中山市肿瘤研究所合作,对所收集的大型高危人群样本库进行ctDNA检测,期望以此增加我们对ctDNA与肿瘤动态发展关系的认识,为液态活检技术在肿瘤早期筛查中应用奠定基础。

联合国癌症统计及分析机构IRAC的数据显示,每年有超过1400万人罹患癌症、820万人死于癌症。液态活检发展至今,虽然已经取得了很多成果,但其技术水平仍未完全成熟,这也让从事相关研究的科研人员感到一种迫切的责任感。我们也希望基于以优秀的技术,开发出更好的产品,对肿瘤的早期筛查作出贡献,拯救更多人的生命。

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CXCR4抗体[ umb2 ](ab124824)

种属反应性

与反应:小鼠、大鼠、人
  • 应用 AB评论 说明 WB 1 / 100。预测分子量:分子量为39 kDa的。可以阻断CXCR4肽(ab155072)

    被CXCR4膜蛋白,我们建议不要煮后样品的溶解(在WB凝胶加载样品)。

    ihc-p 1 / 500。进行热介导抗原修复免疫组化染色协议开始之前。

    见协议(链路:http://www.abcam.com/protocols/ihc-antigen-retrieval-protocol)。

    国际商会/如果 使用浓度为5µ克/毫升。
  • 靶标

    • 功能受体为CXC趋化因子CXCL12 / SDF-1,转导的信号,通过增加细胞内钙离子水平和增强MAPK1 / MAPK3激活。作为一个外泛素受体;从而提高胞内钙离子和细胞内cAMP水平降低。参与造血和心脏室间隔的形成。游戏也在胃肠道血管的重要作用,可能是通过调节血管的分支和/或重构过程中内皮细胞。可能涉及小脑发育。在中枢神经系统中,可通过介导的海马神经元的存活。作为一个受体(CD4是主要的受体)HIV-1 X4株和一些HIV-2分离菌的主要受体。促进环境的病毒介导的融合。
    • 组织特异性在许多组织中表达,如外周血白细胞、脾脏、胸腺、脊髓、心脏、肺、肝脏、胎盘、骨骼肌、肾、胰腺、小脑、大脑皮质和髓质(小胶质细胞和星形胶质细胞),脑血管、冠状动脉、脐静脉内皮细胞。亚型1的测试在所有组织中占主导地位。
    • 疾病相关缺陷是引起CXCR4 WHIM综合征(心血来潮)[ 193670 ];MIM:又名疣、低丙种球蛋白血症、感染和骨髓粒细胞缺乏症。幻想症的特征是中性粒细胞减少症的免疫缺陷病、低丙种球蛋白血症和广泛的人类乳头状瘤病毒(HPV)感染。尽管外周中性粒细胞减少,骨髓穿刺影响个体含有丰富的成熟粒细胞,这种情况被称为骨髓粒细胞缺乏症。
    • 序列相似性属于G蛋白偶联受体1的家庭。
    • 结构域氨基末端是配体结合的关键。在所有的四个胞外区域的残基有助于HIV-1辅助受体活性。
    • 翻译后修饰磷酸化的受体激动剂刺激。迅速磷酸化的C-末端的丝氨酸和苏氨酸残基。在ser-324和ser-325磷酸化导致招聘痒,泛素化蛋白的降解。泛素化的痒在激动剂刺激细胞膜。泛素依赖的机制,所需的运输(ESCRT)胞内分选复合体,然后目标CXCR4的溶酶体降解。这个过程还取决于丝氨酸/苏氨酸在之前CXCR4的C-末端磷酸化。同时结合arrb1斯塔姆负调节CXCR4排序溶酶体通过调节泛素化sfr5s。硫酸化tyr-21是CXCL12 / SDF-1α有效结合需要和促进二聚化。O,N-糖基化。asn-11是N-糖基化的主要部位。似乎有很少或没有糖基化对asn-176。N-糖基化面具辅助受体功能的X4和R5 HIV-1实验室适应主要通过与Env糖蛋白的抑制作用。O-糖基化的硫酸软骨素的依恋并不影响CXCL12 / SDF-1α及其受体活性的作用。
    • 细胞定位细胞膜。在未受刺激的细胞中,细胞膜上的扩散模式。对激动剂刺激,共定位在细胞膜上的痒就泛素化。
    • 以上信息来自:UniProt加入目标p61073UniProt协会通用蛋白质资源(UniProt)2010
      核酸研究38(2010):d142-d148

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    无线风速·温度计ISA – 101型|柴田科技有限公司-环境检测设备、科学仪器的制造销售

    产品详细

    环境测定仪器

    无线风速·温度计ISA – 101型

    Wireless Wind speed and Temperature Meter Model : ISA – 101

    无线风速·温度计ISA - 101型|柴田科技有限公司-环境检测设备、科学仪器的制造销售

    本产品是「探头”和“显示单元」的2个组成,根据蓝牙®无线通信利用风速和温度测量。
    无线风速·温度计ISA - 101型|柴田科技有限公司-环境检测设备、科学仪器的制造销售

    • 无线风速·温度计ISA - 101型|柴田科技有限公司-环境检测设备、科学仪器的制造销售
    • ®●蓝牙通讯可以
      无线通信的到达的范围(约5米以内)的话,无线的测量。

       

      ●显示单元简单测量
      测量值显示,不仅测量值的暂停,时间常数的切换,平均·最大/最小值的运算也是可能的。

       

      ●探针,弯曲和直也使用可能
      直角折弯,也挺也能使用的目盛付探测器。

       

      ●挑高2700毫米到测量可能
      探针是伸缩式的延长棒内置。所以,天花板高2700毫米到可以测量。市面上的一张和三脚架使用,更高处测量也可以。

       

      ●宽风速范围和高精度的测量
      0.05米/秒30米/秒为止和广泛的风速范围覆盖。测量精度±实现3.5 %。

    商品代码其他情报(式样)

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    产品照片 无线风速·温度计ISA - 101型|柴田科技有限公司-环境检测设备、科学仪器的制造销售
    无线风速·温度计ISA - 101型|柴田科技有限公司-环境检测设备、科学仪器的制造销售
    商品代码 080280 – 101
    型式 ISA – 101
    测量对象 纯净的空气流
    测量范围(探头) 风速:0.01~30米/秒温度:—20~70℃
    测量精度(探头) 风速:±指示值的3.5 %或0.05米/秒的大的一方:±0.5℃温度
    表示分辨率(探头) 风速:0.01米/秒(小数点以下一位数固定时:0.1米/秒)温度:0.1℃
    反应性(探头) 风速:约一秒(风速0→1米/秒的时候,90%响应)温度:约30秒(风速1米/秒中90%响应)
    动作方式、传感器(探头) 风速:热式(白金绕组传感器)温度:测温抵抗体(Pt 1000)
    动作环境(探头) – 20~70℃(没有)结露
    功能(探头) 蓝牙通讯(显示单元),连接电缆(显示单元有线连接电缆),(手边开关电源ON / OFF,测量值保持等),LED显示(电池残量,Bluetooth通讯状态)、I·L两用伸缩式探头(毫米刻度刻印),三脚架安装孔(手机吊饰金属零件兼用)
    < trans data-src="電源(プローブ)">电源(探头) 单3电池×2个,或电缆连接时的显示单元贯穿的AC适配器(商品)的电源供给※AC适配器(商品)Micro USB连接器类型的AC适配器及充电器(DC5V,0.2 A以上)使用可能
    连续使用时间(探头) 大约20小时(风速5米/秒,20℃,碱性电池使用时)
    尺寸(探头) 把手部:25(W)×38.5(D)×148(H)毫米传感器部:φ8(最大φ10)×17~608毫米
    质量(探头) 约150克(包括电池)
    动作环境(显示单元) 5~40℃(没有)结露
    表示(显示单元) 白色背照灯液晶
    功能(显示单元) 蓝牙通讯(专用探头),连接电缆(专用探头有线连接电缆),测量值保持,平均·最大·最小值运算,时间常数切换(1 or 5秒),单位切换(风速:米/秒,FPM,温度:℃、°F),背光ON / OFF / 5秒后自动关闭
    电源(显示单元) 单3电池×2个,AC适配器(AC 100~240 V,50 / 60Hz)(商品)
    连续使用时间(显示单元) 约50小时(20℃,碱性电池使用时)
    尺寸(显示单元) 62(W)×23.5(D)×100(H)毫米
    质量(显示单元) 约125克(包括电池)
    附件 走步箱,单3电池×4本(测试用),探头电缆(1.5米)、手机吊饰金属零件(三脚架安装孔到固定),探头罩
    价格(不含税) 98万日元。

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