利用测序能力揭开微生物之谜

利用测序能力揭开微生物之谜

微生物就在我们周围,但关于它们的许多事情仍然是个谜。传统方法只能有限地了解微生物的广泛范围和复杂功能。然而,新的测序技术正在解开这些微观之谜。从抗生素耐药性到生物修复,这种不断加深的认识预示着微生物学的复兴,并为所有人带来更安全、更健康的未来。

高通量测序使研究人员能够快速生成细菌菌株的基因组数据,揭示其遗传学、代谢和生态学的见解。随着测序技术的不断进步,Helvetica Health Care可以通过其产品帮助您阐明微生物群落对医学、生物技术和环境的影响。测序是了解微生物并发挥其造福人类潜力的关键。 

了解微生物之谜

微生物世界是一个巨大而复杂的生态系统,充满了从细菌到真菌和病毒的微生物。这些微小的生命形式通常是肉眼看不见的,但它们在维持生态系统的微妙平衡方面发挥着很大的作用。然而,研究微生物的传统方法,例如显微镜和培养技术,具有固有的局限性,阻碍了对其复杂性的全面理解。

显微镜虽然在观察微生物形态方面具有无价的价值,但无法提供对其基因组成和功能的详细了解。另一方面,培养技术仅捕获微生物多样性的一小部分,因为许多微生物,包括某些细菌菌株,难以在实验室环境中培养。这些局限性凸显了对微生物研究的变革性方法的需求,而这就是测序能力作为游戏规则改变者出现的地方。

利用测序能力揭开微生物之谜

微生物基因组的秘密

解开微生物生命秘密的关键在于破译它们的基因组。 DNA 测序是一个揭示核苷酸复杂顺序的细致过程,它构成了微生物基因组学的基础。与传统方法不同,测序可以全面详细地了解微生物基因组,包括细菌菌株的测序

这项强大的技术使研究人员能够深入研究微生物群落的复杂运作、查明功能途径并破译进化模式。从测序中获得的全面见解对于揭示微生物在不同生态系统中发挥的多方面作用非常宝贵。

通过研究这一点,科学家们发现了新的抗生素,增强了我们对抗抗生素耐药性的能力。此外,对微生物基因组学的深入了解为基于微生物的疗法的发展铺平了道路,凸显了测序技术推动医学突破的潜力。

测序能力:创新之路

由技术驱动的微生物测序已经走出实验室的局限,成为各个领域创新的驱动力。在医疗保健领域,测序揭示了微生物基因组成,从而可以实现个性化医疗,为患者量身定制治疗方案。 

环境科学极大地受益于测序能力。研究从海洋深处到土壤微生物组的不同生态系统中的微生物群落,可以提供对环境健康和恢复力的见解。跟踪微生物多样性和功能随时间变化的能力增强了我们对环境动态的理解,有助于制定明智的保护和管理策略。

此外,在生物技术中,测序充当工业流程进步的催化剂,例如发酵和生物基产品。该应用还扩展到农业,微生物基因组学有助于开发可持续实践和设计作物健康的微生物组增强解决方案。

利用测序能力揭开微生物之谜

发现新的可能性 

测序开启了微生物研究的新纪元。揭开微生物基因组之谜的能力具有深远的影响,从医疗保健、环境科学到生物技术。

通过对不同环境中发现的细菌菌株进行测序,可以更好地了解微生物在生态系统和人类健康中发挥的作用。测序的变革性影响不仅限于实验室;它在理解和利用微生物世界的更广泛背景下产生了共鸣。 

借助创新的基因组工具,科学家们有能力挖掘微生物的巨大潜力,塑造一个未来,微生物的奥秘不仅被解开,而且被用来改善人类和地球。 

选择值得信赖的供应商,以避免在挑选所需菌株时出现质量问题。在 Helvetica Health Care,我们的目标是提供高效的测试和诊断产品,以加强菌株研究。我们提供多种灭活生物体,有多种形式,包括纯化病毒、细胞培养物、灭活培养液和病毒裂解物。我们的病毒裂解物产品在灭活前通过蔗糖梯度离心纯化,我们的细菌菌株集合可作为 PURIFIED DNA(或 NATtrol)使用。大多数细菌都是临床分离株,原种培养物的身份通过 16S 核糖体基因测序来确认。

HHC 致力于扩大我们的病毒和细菌收集范围。我们的产品有多种形式,旨在满足您的研究和产品开发需求。

用于 DNA 和 RNA 测序的 CleanPlex 扩增子测序

用于 DNA 和 RNA 测序的 CleanPlex 扩增子测序

CleanPlex ®是一种超可扩展且超灵敏的NGS 扩增子测序技术。它具有高度先进的专有多重 PCR 引物设计算法、极其均匀的多重 PCR 扩增化学物质 和 创新的背景清洁化学物质。它们共同使得 CleanPlex 即用型和定制 NGS 面板能够突破传统的基于扩增子和基于混合捕获的目标富集技术的限制。


功能亮点:

  • 超高的扩增均匀性和超低的PCR背景噪音(更准确的变异调用或更低的测序成本)

  • 单管 3 小时工作流程,手动操作时间最少(轻松自动化)

  • 兼容困难样品(降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA)和主要测序平台(Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq)

  • 高的灵敏度(低至单细胞水平直接扩增*)

  • 出色的面板大小可扩展性,单个多重 PCR 池中的扩增子数可达 20,000 多个

  • 检测和分析单核苷酸变异(SNV)、小插入和缺失(Indels)、拷贝数变异(CNV)、基因融合/剪接变异、基因表达水平、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)、内部串联复制(ITD)等

以下是从 DNA 提取到测序数据分析的高级靶向测序工作流程(图 1)。目标富集和文库制备工作流程(步骤 2)至关重要,通常决定测序数据的质量。


用于 DNA 和 RNA 测序的 CleanPlex 扩增子测序

以下是 CleanPlex DNA 扩增子测序文库制备的典型工作流程(图 2)。 CleanPlex DNA 工作流程涉及 3 个简单步骤,每个步骤包括热循环或孵育反应,然后使用磁珠进行文库纯化。简化的方案仅需 3 小时即可完成。在步骤 1 中,在多重 PCR 反应中扩增感兴趣的靶标。在步骤 2 中,引物二聚体、非特异性 PCR 产物和复杂的分子碎片在具有创新和专有 CleanPlex 背景清洁化学的消化反应中被生化去除。在步骤 3 中,通过 PCR 索引反应为文库添加样本索引条形码。输入材料可以是基因组 DNA 和从 FFPE、新鲜/冷冻组织或血液活检中提取的 DNA。通过在前面添加逆转录步骤,输入材料也可以是RNA。 (图3)

用于 DNA 和 RNA 测序的 CleanPlex 扩增子测序

eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒C5868


eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒

简要描述:eBgDy™ Terminator v3.1 循环测序试剂盒用于对 DNA 样本进行桑格测序。eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒

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品牌 其他品牌 供货周期 一个月
应用领域 医疗卫生,化工,生物产业,制药,综合

eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒

eBgDy™ Terminator v3.1 循环测序试剂盒用于对 DNA 样本进行桑格测序。它旨在提供具有高精度和最小噪音的高质量测序数据。

eBgDy™ Terminator v3.1 循环测序试剂盒可直接替代 Applied Biosystem 的 BigDye™ Terminator v3.1 循环测序试剂盒。当前 BigDye™ v3.1 用户可以无缝切换到 eBgDy™ v3.1,而无需更改当前协议。无需安装新软件或移动转移文件。也不需要新的校准或验证。

该试剂盒包括 eBgDy™ Terminator v3.1 测序混合物,其中包含用不同荧光染料标记的双脱氧核苷酸终止子的专有混合物。该混合物还包括 DNA 聚合酶,它将退火的引物延伸到 DNA 模板上,并掺入荧光标记的双脱氧核苷酸终止子,从而导致链终止和不同长度 DNA 片段的合成。

测序反应通常在热循环仪中进行,它使用一系列温度循环来控制引物的退火和延伸。反应完成后,产物被纯化并加载到毛细管电泳仪器上,例如Applied Biosystems 3730xl DNA分析仪,它按大小分离片段并检测荧光信号。

eBgDy™ Terminator v3.1 循环测序试剂盒具有以下功能:

  •     高准确度:该试剂盒提供高质量的测序数据,准确度高,噪音极小,适合广泛的应用,包括从头测序、变异检测和基因分型。

  •     应用范围广:该试剂盒可用于多种DNA模板的测序,包括PCR产物、质粒、BAC、fosmid等。

  •     易于使用:该试剂盒设计易于使用,具有简单的反应设置和标准化方案。


与 BigDye™ v3.1 相比,eBgDy™ v3.1 还带来了许多优势

  • 更快的反应周期:eBgDy™ 需要 3 分钟的延伸时间,而不是 4 分钟,如果需要,可以进一步缩短至 2 分钟。

  • 更高的稀释倍数:只需 0.15 µl 的 eBgDy™ 即可在 5 µl 总体积反应中成功使用(图 1)

  • 更高的成功率:特别是对于困难的模板(图2)

 

eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒C5868

图 1 上图:使用 0.15 µl BigDye™ v3.1 得到的正常模板的原始测序信号,一式两份。下图:使用 0.15 µl eBgDy™ 得到的相同正常模板的原始测序信号。总反应体积为 5 µl。
 eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒C5868

图 2 上图:使用 0.15 µl BigDye™ v3.1 得到的富含 GT 模板的原始测序信号,一式两份。下图:使用 0.15 µl eBgDy™ 得到相同 GT 丰富模板的原始测序信号。总反应体积为 5 µl。

 

eBgDy™ Terminator 3.1 循环测序试剂盒C5868

图3.使用在 ABI 3730XL DNA 分析仪上运行的 eBgDy™ Terminator v3.1 循环测序试剂盒获得 DNA 测序碱基检出结果。


上海金畔生物科技有限公司

  1. 国内试剂耗材经销代理。

  2. 国外试剂的订购。可提供欧美实验室品牌的采购方案。

  3. 提供加急物流处理,进口货物,最快交期1-2周。

  4. 进出口货物代理服务。

  5. 公司代理众多有名生命科学领域的研究试剂、仪器和实验室消耗品品牌

  6. 质量保证,所有产品都提供售后服务。付款方式灵活。公司坚持“一站式”服务模式。

使用 RNA 测序对细胞类型进行分类

使用 RNA 测序对细胞类型进行分类

RNA 测序 (RNA-seq) 是一项革命性技术,改变了基因组学领域。它为研究人员揭示细胞和分子水平上发生的许多复杂过程开辟了新途径。与 DNA 测序不同,RNA-seq 通过提供任何给定时间所有活性基因的快照来深入了解基因组的功能元件。那么,这如何帮助用户对不同的细胞类型进行分类呢?请继续阅读以了解更多信息。

RNA 测序在细胞类型分类中的威力

RNA 测序已成为细胞类型分类的强大工具。它使科学家能够识别特定的细胞类型并了解它们在各种生物过程中的作用。这是因为 RNA-seq 能够分析单个细胞中的基因表达水平。许多研究领域都将从这种开创性的方法中受益,但它在研究肺纤维化等疾病方面已经显示出非凡的潜力,在这些疾病中,不同细胞群的作用尚未全了解。

单细胞 RNA 测序:游戏规则改变者

单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 将 RNA 测序提升到一个新水平。它使科学家能够分析单个细胞的转录组,提供细胞类型和状态的高分辨率视图。与传统的 RNA 测序方法相比,这是一个重大进步,传统的 RNA 测序方法提供大量细胞的平均基因表达谱。

在最近一项题为“单细胞 RNA 测序揭示肺纤维化中不同上皮和间质谱系的促纤维化作用“的研究中,scRNA-seq 被用来揭示肺纤维化的复杂细胞景观。该研究使用 10x Genomics Chromium 平台进行单细胞 RNA 测序,该平台生成乳液中的单细胞凝胶珠 (GEM),用于逆转录过程以创建 cDNA。然后对该 cDNA 进行扩增并用于测序。

DeNovix 在 RNA 测序中的作用

DeNovix DS-11 FX+ 分光光度计/荧光计在这项研究中发挥了至关重要的作用。该仪器用于定量 RNA,这是 RNA 测序过程中的关键步骤。RNA的定量确保了测序过程有足够的材料,并有助于保证样品的质量。这是 10x Genomics 平台单细胞 RNA 测序的准备步骤。

细胞计数是 RNA 测序的另一个重要准备步骤。在一项相关研究“模拟人类肺细胞暴露于野火中发现异常的 lncRNA 特征“中,DeNovix CellDrop™ 系统用于在 0.4% 台盼蓝 1:1 稀释液中对人类永生化支气管气管细胞 (AALE) 进行计数,并在其死亡前 24 小时进行计数。直接烟雾暴露(DSE)。暴露于气液界面 (ALI) 室后,细胞用于 RNA 测序分析,以识别 IncRNA 的变化。结果表明烟雾成分对于野火烟雾的分子效应的重要性。具体来说: 

“我们的结果阐明了化学成分(以及地理来源)在评估野火烟雾暴露可能导致的呼吸系统健康风险方面的重要性。我们使用通过实验生成的 RNA-seq 数据进行公正的分析,旨在识别差异表达的转录本,在这里,通过严格和全局的分析,我们证明不同的野火烟雾会诱导 lncRNA 的异常表达。”

机器学习和 RNA 测序

机器学习是另一种越来越多地与 RNA 测序结合使用的工具。通过训练已知细胞类型的数据,机器学习算法可以根据细胞类型的基因表达谱对细胞类型进行分类。这可以大大提高细胞类型分类的准确性和效率。

RNA测序的应用

RNA-seq 的应用广泛且多样。从了解疾病中细胞群的复杂性到发现选择性剪接变体,RNA-seq 是现代基因组学库中的多功能工具。

RNA 测序的未来

随着新技术和方法的不断开发,RNA测序的未来是光明的。对不同 RNA 分子及其表达水平的研究不断增长,这将与 RNA-seq 的进步契合,并扩大我们可以理解的细胞类型的数量。 

在 DeNovix,我们很自豪能够成为这个令人兴奋的领域的一部分。我们邀请您探索我们的产品和服务范围,并与我们一起突破 RNA 测序的可能界限。使用我们的组合分光光度计/荧光计和开创性的自动细胞计数器,用户可以优化 RNA 测序的准备步骤,以保证最高的质量。我们可以一起继续解开细胞的秘密,并在分子水平上增进我们对生命的理解。

宜曼达测序试剂-测序试剂盒


illumina MiSeq 试剂盒 v3

简要描述:MiSeq Reagent Kits v3 可实现所有 MiSeq 试剂盒的最高产量。 v3 试剂盒保留与 v1 和 v2 试剂盒相同的预填充、即用型试剂盒,但提供改进的化学以增加簇密度和读取长度以及提高质量 (Q) 分数。 illumina MiSeq 试剂盒 v3(MiSeq Reagent Kit v3)

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品牌 其他品牌 供货周期 一个月
应用领域 医疗卫生,环保,食品,化工,生物产业

illumina MiSeq 试剂盒 v3MiSeq Reagent Kit v3

Illumina公司作为基因组学研究领域的技术与市场者,借助新一代测序与基因芯片技术与平台,持续推动生命科学、转化及消费者基因组学和分子诊断的进步。

MiSeq Reagent Kits v3 可实现所有 MiSeq 试剂盒的最高产量。 v3 试剂盒保留与 v1 和 v2 试剂盒相同的预填充、即用型试剂盒,但提供改进的化学以增加簇密度和读取长度以及提高质量 (Q) 分数。

MiSeq Reagent Kit v3 允许研究人员:

  • 单次运行产量翻倍

  • 使用 600 循环试剂盒将读长延长至 2 x 300 bp

  • 将读取次数提升至2500万,解锁新应用

MiSeq v3 套件可以使每个流动槽的产量翻倍。试剂盒以 600 个循环的形式提供,可在任何 Illumina 测序系统上实现最长的读取长度。还有一种 150 周期格式可实现计数应用。此外,所有MiSeq Reagent Kit v2 配置将继续可用。 MiSeq 试剂组件采用 RFID 编码并与 MiSeq 系统智能交互,以验证与用户定义应用程序的兼容性。

试剂盒 读取次数 套件尺寸(周期) 输出(最大) 2 × 75 输出 2 × 300 输出
MiSeq 试剂盒 v3 25 米 150, 600 15GB 3.8GB 15GB

Gb = 千兆碱基,M = 百万

上海金畔生物科技有限公司专业销售进口品牌实验室产品。公司是一家专注于分子生物学、细胞生物学、细菌学、遗传学、免疫学、生物化学、蛋白质学、细胞治疗、临床应用等领域,以销售为主的生物技术公司。销售的产品涉及,细胞株和菌株、胎牛血清、生化试剂、ELISA试剂盒、抗体和抗原、细胞因子、技术服务、实验耗材和消耗品、仪器设备等。

我司代理国内外众多生命科学领域的研究试剂、仪器和实验室消耗品,公司坚持“一站式”服务模式,为客户全面解决实验、生产、开发需求。

illumina MiSeq 试剂盒 v3MiSeq Reagent Kit v3

超纯+高灵敏dNTP,让测序多重保障

三十多年来,测序技术以前所未有的速度从手工测序发展到现在的高通量输出,广泛应用于基础生物学、考古学、产前诊断等众多领域。

超纯+高灵敏dNTP,让测序多重保障

第一代测序技术:是在Sangar DNA链终止法和DNA 化学降解测序法基础上发展来的自动测序技术,依赖放射性同位素标记(32P、35S)来实现。20世纪80年代,科学家们开始用荧光标记的测序技术取代同位素标记测序。


第二代测序技术:在Sangar等测序方法的基础上,用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP,当DNA聚合酶合成互补链时,每添一种dNTP就会释放出不同的荧光,根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件车里,从而获得待测DNA的序列信息。


第三代测序技术:与二代测序类似,也是一种边合成边测序的技术,但并不需要进行聚合酶链式反应扩增,能够直接观察和测定DNA分子的数量和序列的结构。


以上三种测序技术过程均需要用到大量的dNTP和ddNTP原料。

Jena Bioscience 是以核苷、核苷酸类似物为特色产品的生物公司,同时也是标记核苷酸的全球领先供应商。能提供超纯级别(≥98%HPLC)、高灵敏度的dNTP、ddNPT和标记核苷酸,有单组分溶液(single solutions)、多组分溶液(Bundles)、预混型溶液(Pre-Mixes)和冻干粉末(Lyophilisates)等多种包装形式,此外还有高质量的DNA聚合酶、连接酶等。

名称

货号

规格

dATP-solution

NU-1001L 1ml(100μmol)

dCTP-solution

NU-1002L

1ml(100μmol)

dGTP-solution

NU-1003L

1ml(100μmol)

dTTP-solution

NU-1008L

1ml(100μmol)

dITP-solution

NU-1007L

1ml(100μmol)

dUTP-solution

NU-1005S

1ml(100μmol)

dNTP Bundle

NU-1005S

4X200μL4X20μmol

NU-1005L

4X1mL4X100μmol

dNTP Bundel dUTP

NU-1009S

4X200μL4X20μmol

NU-1009L

4X200μL4X20μmol

dNTP Mix/10mM

NU-1006S

400μL

NU-1006L

2X1mL

dNTP Mix/25mM

NU-1023S

200μL

NU-1023L

1mL

dNTP Mix Dutp/10mM

NU-1020S

200μL

NU-1020L

1mL

dNTP Mix Gcamplifier

PCR-257

100μL

dATP-Solid

NU-1001-10

10mg

dCTP-Solid

NU-1002-10

10mg

dGTP-Solid

NU-1003-10

10mg

dTTP-Solid

NU-1004-10

10mg

dITP-Solid

NU-1040-10

10mg

dUTP-Solid

NU-1041-10

10mg


Jena Bioscience产品覆盖应用广,种类齐全:核苷、核苷酸及类似物、重组蛋白及蛋白表达系统、点击化学产品系列、生物大分子结构相关试剂等。


上海金畔生物科技有限公司是Jena Bioscience 在中国的独家一级代理,拥有成熟的服务体系和现货库存,如您对以上产品感兴趣欢迎拨打上海金畔生物科技有限公司全国客服热线021-50837765,或者登陆官方网址www.jinpanbio.com查询产品详细信息。

德国AppliChem分子生物学级去离子甲酰胺Formamide deionized(A2156)

一个大于150-200个碱基对的长链DNA或RNA在98%的甲酰胺中就可以完全变性(常温条件下),但在7M的尿素中却不可以,而且在这种条件下不影响碱基组成和二级结构,可以得到完好的DVA或RNA单链。聚丙烯酰胺凝胶中包含了98%的无水的去离子甲酰胺,加样缓冲液中也包含了甲酰胺,同样的包含了甲酰胺的测序胶是可以用在核酸的测序技术上的,含有40%的甲酰胺就可以克服测序产品二级结构迁移和压缩的问题。

RNA在甲酰胺中的稳定性比在DEPC水好很多,在-20°C的甲酰胺中RNA能够储存至少一年,可以取代在-70°C DEPC水中储存这种方式。

去离子甲酰胺凝胶电泳除了可以应用在核酸杂交实验外,甲酰胺还可以降低DNA双链的解链温度,平均每1%的甲酰胺就可以降低0.6°C ,甲酰胺的较大浓度可以达到50%,随着甲酰胺的增加,杂交过程的温度也会随着降低,另外RNA探针的杂交背景也会减少。

品牌

货号

品名

规格

报价

AppliChem

A2156

Formamide deionized Molecular biology grade

100ml

420

AppliChem

A2156

Formamide deionized Molecular biology grade

250ml

607

AppliChem

A2156

Formamide deionized Molecular biology grade

500ml

789

AppliChem

A2156

Formamide deionized Molecular biology grade

1L

1265

A2156的主要参数:

分子量:45.04 g/mol

CAS#:75-12-7

熔点:2°C

沸点:210°C

使用浓度:10 – 100 mM

储存条件:室温

Applichem是欧洲权威生化试剂供应商,ITW基团成员公司,德国著名品牌,产品种类齐全,性价比高。上海金畔生物科技有限公司是Applichem在中国的唯一代理商,大量热销产品我们常年备有现货,更多产品咨询与订购,欢迎来电全国服务热线:021-50837765