RNA 定量的最佳技术介绍

RNA 定量的最佳技术介绍

RNA 和 DNA 定量(有时称为核酸定量)可确定给定样品中 RNA 或 DNA 的浓度。定量过程的一部分可能涉及处理混合物样品,可能含有多种污染物,例如蛋白质、其他核酸或有机化合物。

什么是RNA定量?

有多种实验方法可用于 RNA 定量。其中包括用于 RNA 定量、荧光或分光光度测量的 PCR 方法。 

用于RNA 定量的分光光度法和荧光法比 PCR 等方法具有多个优势。使用光学方法进行 RNA 定量不需要任何额外的样品制备,非常经济高效且耗时较少。虽然基于 PCR 的方法可以提供良好的灵敏度,但它们更复杂且执行成本更高,并且只有极低 RNA 浓度的 RNA 定量才需要这种水平的灵敏度。 

分光光度法和荧光分析

分光光度测量提供了一种稳健且直接的 RNA 定量方法。RNA 定量通常在 260 nm 下进行,同时还会收集 UV 范围内的一系列波长。大多数蛋白质、小有机分子和核酸在该区域具有很强的吸收和发射特征,从而可以对 RNA 进行定量并识别潜在污染物。

在已知光程下测量的样品吸光度与该样品的浓度成正比。在特定波长(RNA 为 260 nm)下透过样品的光量可用于 Beer-Lambert 方程来计算感兴趣样品的浓度,在本例中用于 RNA 定量。还必须知道感兴趣物种的摩尔吸收系数。

计算摩尔吸收系数相对简单。由于给定波长下的吸光度和光程之间的关系与浓度成线性比例,因此可以测量参考样品的一系列给定稀释度。通过对这些数据点进行线性拟合,可以计算摩尔吸收系数并用于将来的量化。对于 DNA 和 RNA 等充分表征的样品,系数是已知的并包含在分析软件中。 

RNA 定量也可以通过荧光测量来进行荧光测量比基于吸光度的测量具有更高的灵敏度。已经开发出专为激发感兴趣的分析物而开发的检测试剂盒。即使在复杂混合物或存在污染物的情况下,这些也可用于 RNA 定量。样品的荧光量也与浓度成正比,并且可以通过使用已知浓度的类似样品的标准曲线来定量。 

用于 RNA 定量的分光光度计

DeNovix 是生物技术专家,拥有多种针对 RNA 定量进行优化的仪器,包括 DS-11 系列和 QFX 荧光计,这些仪器在设计时考虑了 RNA 定量的一些复杂性。

QFX 荧光计具有出色的灵敏度和特异性,适用于可能涉及高度复杂的混合物或需要在极低浓度下进行 RNA 定量的挑战性 RNA 定量情况。它配备了四个光源和带有敏感光电二极管的发射通道,所有这些都可以选择用于药理学应用的安全审计跟踪记录。 

DS -11 系列是一款适用于常规样品和珍贵样品的微量仪器。DS-11 可以处理小至一微升的体积,并在最宽的可用动态范围内进行定量。DS-11 还配备了易于使用的软件,可以显示全光谱扫描以及通常用作 RNA 定量和质量控制一部分的 260/280 和 260/230 比率。